Cours international

1ER COURS : BIOINFORMATIQUE ET BIOLOGIE DES SYSTEMES DU CANCER - 2018

L’objectif du cours est de promouvoir l’intégration d’approches computationnelles dans les laboratoires biologiques et cliniques. Nous avons pour but d’aider les participants à améliorer l’interprétation et l’utilisation d’omics ainsi que les données d’imagerie, qui de nos jours s’accumulent dans n’importe quel laboratoire biologique ou médical.

Le cours contiendra les sessions suivantes :
Session 1 : Bases de données sur les voies et ressources des réseaux du cancer
Session 2 : Visualisation et interprétation des données sur le cancer
Session 3 : Génétique des cancers
Session 4 : Analyse des données omics multi-échelle et hétérogénéité des tumeurs
Session 5 : Modélisation mathématique des réseaux de signalisation du cancer
Session 6 : Intégration des données multi-échelle en modèles de signalisation du cancer
Session 7 : Prédiction de la réponse au traitement et stratification du patient
Session 8 : Analyse des données « single cell » du cancer
Session 9 : Informatique « Bioimage » pour la recherche du cancer
Session 10 : Études de l’évolution du cancer

Les approches par biologie des systèmes aident à analyser les mécanismes moléculaires in silico. Malgré la disponibilité des données haut débit sur le cancer (omics) et des données d’imagerie, ces informations ne sont pas entièrement exploitées. Elles ne peuvent donc pas fournir les indices nécessaires sur les mécanismes déréglés, indices qui guideraient vers une stratification plus précise du patient et in fine un traitement personnalisé du cancer. Nous avons invité des experts internationaux, de différents domaines dans la biologie des systèmes du cancer, qui exposeront un large éventail de méthodes : des analyses de données à la modélisation et à l’intégration de schémas thérapeutiques rationalisés dans les essais cliniques.

>>Cliquez ici pour vous inscrire.<<

Le cours peut accueillir 60 à 80 Masters 2, Doctorants et Post-doctorants venant des :
- Universités/équipes françaises
- Universités/équipes européennes
- Universités/équipes internationales

Le cours sera validé par 3 ECTS pour les Masters 2 et les doctorants de l’UPMC (10-15 places) et de l’IBENS-ENS (10 places).

Evaluation des étudiants (par un comité scientifique)
- Masters 2 : les étudiants seront évalués en fonction de leur présentation au Journal Club + activités générales pendant les discussions scientifiques.
- Doctorants : les étudiants seront évalués en fonction de leur présentation flash + posters + activités générales pendant les discussions scientifiques.

Il est demandé aux candidats Post-doc de faire une présentation flash et un poster sur leur recherche scientifique. L’abtract le plus significatif sera choisi pour une présentation orale de 15 minutes.

De plus, nous attendons des participations des chercheurs et des médecins qui sont intéressés par l’impact de la biologie des systèmes dans la recherche sur le cancer et son traitement.

Aucune expérience particulière n’est requise en programmation et modélisation, ou connaissances approfondies de la biologie des systèmes. Les présentations seront conçues de manière didactique, proposant aux participants une introduction sur les fondamentaux de la biologie des systèmes et son application dans la recherche sur le cancer.

Tous les participants seront présents au workshop développement de carrière du samedi matin.

La sélection des participants se fait sur la base de l’ordre chronologique des inscriptions (« Premier inscrit, premier servi »).

Inscription au cours :
- CV (1 page max)
- Description du sujet scientifique sous la forme d’un abstract (1 page max)
- Lettre de motivation expliquant vos raisons pour assister à ce cours (1 page max)
- Lettre de recommandation de la part de 1-2 personnes.

À noter : Si vos référents souhaitent contacter directement le comité scientifique de l’organisation, les lettres peuvent être envoyées directement par courriel à c.sysbiocancer2018@curie.fr tout en respectant la date limite des applications.

24-29 septembre, 2018
25 Juillet 2018

Institut Curie, BDD building, Amphithéâtre BDD
11 Rue Pierre et Marie Curie, 75248 Paris cedex 05
Paris - France

5 août, 2018

Pas de frais d'inscription

Les déjeuners, les pauses café, le buffet de bienvenu et d’adieux seront offerts aux participants

Organisateurs
Emmauel BARILLOT Institut Curie - INSERM U900, Paris, France
Gregory BATT Inria - Saclay - Institut Pasteur, Paris, France
Inna KUPERSTEIN Institut Curie - INSERM U900, Paris, France
Vassili SOUMELIS Institut Curie - INSERM U932, Paris, France
Denis THIEFFRY Institut de Biologie de l'École Normale Supérieure, Paris, France
Jean-Philippe VERT Centre of Computational Biology, MINES - ParisTech, Paris, France
Thomas‎ WALTER Centre of Computational Biology, MINES - ParisTech, Paris, France

Comité Scientifique
Laurence CALZONE Institut Curie – INSERM U900, Paris, France
Tatiana POPOVA Institut Curie – INSERM U830, Paris, France
Andrei ZINOVYEV Institut Curie – INSERM U900, Paris, France

Atelier de développement de carrière (demi-journée le samedi)
Introduction aux opportunités d’évolution de carrière dans la Bioinformatique et biologie des systèmes du cancer.
Présentation de parcours professionnels (plans de carrières) et assistance aux étudiants par (tables rondes) :
- Experts invités
- Représentants de l’industrie pharmaceutique
- Les éditeurs scientifiques

UPMC, Institut Pasteur, IBENS-ENS, MINES-PariTech

Servier
Sanofi
CNRS GDR-BIM
LABEX DC-BIOL
CRC Taylor&Francis Publishing Group