Ce cours s'adresse aux nouveaux arrivants souhaitant apprendre à développer leurs propres pipelines Nextflow. Il aborde la question de la recherche reproductible et des bonnes pratiques en biologie computationnelle, avec une description des composants clés du langage Nextflow. Il aborde également les notions principales de la conception, du développement et de la configuration des pipelines, afin de mettre en place un premier pipeline fonctionnel pendant la formation.
>> INSCRIPTION <<
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- Recherche reproductible – du pourquoi au comment ?
- Définition des bonnes pratiques de développement de code en biologie computationnelle
- Introduction au langage Nextflow et aux principaux concepts de programmation
- Création d'un premier pipeline Nextflow fonctionnel
Nicolas Servant, PhD
Cette liste d'intervenants n'est pas définitive
Nicolas Servant, PhD
- Apportez votre propre ordinateur portable (macOS ou Linux)
18 participants
- Être familier avec l'environnement de ligne de commande et l'écriture de code
