Radiomique : théorie et pratique

Programme préliminaire :

JOUR 1

Session du matin - cours théoriques (en ligne et présentiel)
Brève introduction à la radiomique - I. Buvat 
Révision des concepts de base

Planification de la recherche - I. Buvat
Approche étape par étape de la conception d'hypothèses, de la préparation et de la conservation des données, de l'évaluation des modèles, etc.

Radiomique : extraction de caractéristiques - F. Orlhac
Paramètres pour le calcul des caractéristiques (discretisation, rééchantillonnage spatial), définitions, IBSI, filtres

Questions-réponses interactives

Session de l'après-midi - travaux pratiques (en présentiel uniquement)
Pratique de LIFEx
Lecture et manipulation d'images, segmentation, extraction de caractéristiques radiomiques, scripting

Présentation des projets des participants (facultatif) - session 1 (5 min. par participant)
Dîner convivial

JOUR 2

Session du matin - cours théoriques (en ligne et présentiel)
Reproductibilité des caractéristiques radiomiques : nécessité d'une harmonisation - F Orlhac 
Défi de la reproductibilité en radiomique, effet du centre et de la population, solutions pour l'harmonisation et ComBat

Construction d'un modèle radiomique - J Mullaert
Classification vs prédiction, curation des données, sélection des caractéristiques, modèles

Questions-réponses interactives

Session de l'après-midi - travaux pratiques (en présentiel uniquement)
Pratique de Shiny
Harmonisation des caractéristiques avec ComBat

Pratique de R (ou d'un autre environnement d'analyse statistique)
Curation des données, prétraitement, construction d'un modèle (partie 1)

Présentation des projets des participants (facultatif) - session 2 (5 min par participant)

JOUR 3

Session du matin - cours théoriques (en ligne et présentiel)
Évaluation des modèles - J Mullaert
Métriques, stratégies de validation croisée, validation externe

Interprétation des modèles et rapport d'une étude radiomique - I Buvat
Effet Clever Hans, outils pour guider la rédaction des rapports (CLEAR, METRICS, RQS…)

Questions-réponses interactives

Session de l'après-midi - travaux pratiques (en présentiel uniquement)
Pratique de R (ou d'un autre environnement d'analyse statistique)
Construction d'un modèle (partie 2), évaluation des performances

Utilisation de métriques pour évaluer la qualité d'une étude radiomique

Retour d'information et discussion générale avec les participants