Portrait d'alumni : entretien avec Soumyananda Chakraborti

Pourriez-vous nous décrire votre formation universitaire et votre poste actuel ?

J'ai obtenu une maîtrise à l'université de Calcutta et un doctorat à l'institut Bose de Calcutta. Calcutta est l'une des métropoles les plus peuplées d'Inde. Après mon doctorat, j'ai rejoint l'Institut Curie en tant que chercheur postdoctoral sous la direction de Carsten Janke. J'y suis resté environ un an et demi, puis j'ai rejoint l'Université de l'Indiana, toujours en tant que chercheur postdoctoral. Après un bref séjour aux États-Unis, j'ai de nouveau déménagé en Europe, cette fois en Pologne, où j'ai travaillé comme professeur assistant pendant près de quatre ans. En août 2020, j'ai déménagé en Inde en tant que scientifique indépendant grâce à une bourse très prestigieuse. Mon parcours est donc très intéressant et multidisciplinaire. Par exemple, j'ai fait mon doctorat en biophysique ; pendant mon doctorat, j'ai travaillé principalement sur les interactions protéine-ligand, les changements de conformation des protéines, la structure et les aspects dynamiques des protéines. Après mon doctorat, j'ai rejoint le laboratoire de Carsten, où j'ai principalement travaillé sur les modifications post-traductionnelles (PTM) de la tubuline, en particulier sur les PTM dans la queue terminale C de la tubuline et leur impact sur les interactions protéine-protéine.

Nous voulions étudier comment ces modifications contribuaient à l'interaction avec d'autres protéines et j'ai utilisé la levure de fission comme système modèle. J'ai ensuite rejoint un laboratoire de biologie structurelle aux États-Unis et j'ai commencé à travailler sur les particules de type viral. Les virus sont assez intéressants d'un point de vue structurel et, en raison de leur symétrie, ils peuvent être utilisés pour un certain nombre d'applications en biologie synthétique. Plus tard, lorsque j'ai déménagé en Pologne, j'ai poursuivi mes recherches sur les cages à protéines/VLP et j'ai réussi à publier quelques articles très intéressants, dont un dans Nature, où nous avons montré pour la première fois qu'une cage à protéines synthétique pouvait être créée en combinant des nanoparticules d'or et des protéines normales. Parallèlement, j'ai commencé à explorer la possibilité de combiner la nanotechnologie des protéines et la nanotechnologie de l'ADN pour fabriquer des robots fantaisistes. Nous avons commencé à concevoir des origamis en ADN et essayé d'assembler des cages de protéines. À mon retour en Inde, j'ai pensé que les outils que j'avais développés, toutes ces cages de protéines et ces origamis d'ADN, devraient être appliqués à un modèle de maladie tropicale très répandu en Inde, et j'ai donc choisi le paludisme. J'ai également pensé à utiliser les cages à protéines comme outil d'administration ciblée de médicaments contre la malaria cérébrale, et jusqu'à présent, nos données semblent assez prometteuses. Nous essayons également de comprendre quelques voies fondamentales des moustiques, car il y a un besoin urgent de développer de nouveaux insecticides.

Nous travaillons principalement sur quelques grandes voies métaboliques et de repliement des protéines des moustiques, par exemple i) comment les moustiques reconnaissent leur hôte, ii) comment ils tolèrent le stress et s'adaptent à un nouvel environnement, et iii) comment ils métabolisent le fer. Tel est mon parcours jusqu'à présent. On peut donc dire que le fait de travailler dans des domaines aussi différents m'a aidé à mûrir, car la science est très multidisciplinaire.

Qu'avez-vous appris à l'Institut Curie qui vous a aidé non seulement à définir votre projet professionnel, mais aussi à atteindre vos objectifs professionnels ?  

J'ai passé de très bons moments à l'Institut Curie. Je dois dire que Carsten est quelqu'un de formidable et que j'ai vraiment apprécié mes séjours à Paris ainsi que mon travail à l'Institut Curie. C'est l'une des institutions les plus importantes dans le domaine de la recherche sur le cancer, cela ne fait aucun doute. Elle dispose d'une très belle infrastructure scientifique, d'une culture scientifique très ouverte et constitue un lieu idéal pour la mise en place de réseaux. Le seul inconvénient, je pense, est que si vous ne parlez pas français, votre vie sera un peu moins excitante. Mais sinon, en tant que lieu scientifique, l'Institut Curie est formidable. Cela m'a beaucoup aidé parce que c'était la première fois que j'étais à l'étranger et maintenant cela m'aide à prendre des décisions, à travailler en réseau, à approcher les gens, ce qui est très important de nos jours dans le domaine scientifique, et cela m'initie à de nouveaux domaines scientifiques. L'Institut dispose d'infrastructures de pointe en biologie cellulaire. Cette expérience m'a donné l'opportunité d'être dans un milieu très multiculturel, avec beaucoup d'étudiants et de chercheurs internationaux, ce qui m'a aidé. Et j'ai vraiment apprécié la liberté dont je disposais avec Carsten. Cela a été très important pour moi, car cela m'a permis d'évoluer en tant que scientifique indépendant. J'ai également publié deux articles, ce qui m'a aidé dans ma future carrière. L'Institut Curie est une excellente plateforme d'apprentissage, en particulier pour les doctorants et les postdocs.

Comment décririez-vous votre expérience à l'Institut Curie ? Y a-t-il une expérience mémorable que vous aimeriez partager ?  

Comme je vous l'ai dit, j'ai beaucoup apprécié cette expérience. J'ai participé à une retraite, ce qui a été ma première rencontre avec une très grande communauté de biologistes cellulaires, et ce fut une expérience formidable. J'ai appris à faire un discours passionnant devant une grande communauté car avant cela, je m'exprimais principalement devant un public national, avec une exposition limitée à un public international. C'était une expérience mémorable pour moi. Par ailleurs, j'ai assisté à de nombreuses conférences pendant mon séjour à l'Institut Curie, ce qui a renforcé ma confiance en moi car de nos jours, il faut être un bon orateur. Il ne suffit pas de faire de la bonne science. Il faut aussi savoir la présenter. C'est ce que l'Institut Curie m'a vraiment appris. Carsten est également un excellent présentateur, un orateur exceptionnel, devrais-je dire. J'ai appris toutes ces choses uniquement à l'Institut Curie : comment présenter et comment communiquer avec d'autres scientifiques.

Que pensez-vous lorsque vous vous comparez aujourd'hui, en tant que chercheur, à l'époque où vous étiez doctorant, puis post-doctorant ?  

Après votre postdoc, vous avez plus de responsabilités. Lorsque vous êtes postdoc, vous n'avez pas besoin de penser à vos étudiants. Pendant les 5 à 7 premières années en tant que scientifique junior ou professeur assistant, vous devez vous forger une réputation dans le domaine, ce qui vous met face à plusieurs défis. Lorsque vous êtes doctorant ou post-doctorant, vous vous concentrez sur vos recherches et vos publications. Le plus grand avantage est que les gens travaillent sur vos idées. Lorsque vous êtes postdoc, vous travaillez principalement avec les idées de votre superviseur, mais maintenant je travaille principalement avec mes propres idées. C'est un avantage, mais comme pour tous les avantages, il faut en payer le prix. Vous devez donc constamment penser à vos doctorants ou à vos postdocs, à la manière de gérer le laboratoire, etc.

De votre point de vue, qu'est-ce qui différencie l'Institut Curie des autres instituts de recherche ?

C'est un institut très international par rapport aux autres instituts français. Il dispose d'un programme doctoral international. Il recrute également les meilleurs dans le domaine, ce qui constitue un autre avantage de rejoindre l'Institut Curie. Vous aurez l'occasion de travailler avec les meilleures personnes au monde. Ils disposent d'une infrastructure impressionnante. Enfin, ils organisent très fréquemment des conférences et des réunions, ce qui vous donne une visibilité internationale au sein de la communauté scientifique. À part Pasteur, je ne pense pas qu'un autre institut à Paris puisse offrir une telle exposition.

Avez-vous quelque chose à ajouter ? Peut-être un conseil à donner aux doctorants et post-doctorants de l'Institut Curie ?

Ce n'est pas un conseil, mais je pense qu'il faut d'abord être passionné. Si vous voulez faire de la science, ne le faites pas si vous pensez que c'est un travail. C'est la chose la plus importante. Vous devez être enthousiaste à l'égard de la science, car vous n'obtiendrez pas toujours des données favorables. Nos expériences se soldent le plus souvent par des échecs. La science est également très compétitive, il faut donc être patient et passionné pour réussir. De nos jours, je pense qu'il est également important de se créer un réseau, car c'est aussi un facteur très important dans le domaine scientifique. Enfin, le troisième facteur le plus important est qu'il faut être un bon orateur, il faut savoir se présenter devant le public. Vous pouvez être un très bon chercheur, mais vous devez être un tout aussi bon présentateur de votre recherche.

Entretien réalisé par Ana Luisa Dian, étudiante en doctorat.