Les approches par biologie des systèmes aident à analyser les mécanismes moléculaires in silico. Malgré la disponibilité des données haut débit sur le cancer (omics) et des données d’imagerie, ces informations ne sont pas entièrement exploitées. Elles ne peuvent donc pas fournir les indices nécessaires sur les mécanismes déréglés, indices qui guideraient vers une stratification plus précise du patient et in fine un traitement personnalisé du cancer.
Nous avons invité des experts internationaux, de différents domaines dans la biologie des systèmes du cancer, qui exposeront un large éventail de méthodes : des analyses de données à la modélisation et à l’intégration de schémas thérapeutiques rationalisés dans les essais cliniques.
Le cours contiendra les sessions suivantes :
Session 1 : Bases de données sur les voies et ressources des réseaux du cancer
Session 2 : Visualisation et interprétation des données sur le cancer
Session 3 : Génétique des cancers
Session 4 : Analyse des données omics multi-échelle et hétérogénéité des tumeurs
Session 5 : Modélisation mathématique des réseaux de signalisation du cancer
Session 6 : Intégration des données multi-échelle en modèles de signalisation du cancer
Session 7 : Prédiction de la réponse au traitement et stratification du patient
Session 8 : Analyse des données « single cell » du cancer
Session 9 : Informatique « Bioimage » pour la recherche du cancer
Session 10 : Études de l’évolution du cancer
Le succès de ce cours repos sur la participation active des participants, qui sont invités à contribuer aux événements suivants :
- Présentation de leur projet de recherche scientifique avec présentation flash et un poster
- Participation au Journal Club afin de présenter et discuter autour de l'impact de la biologie des systèmes dans la recherche sur le cancer et son traitement
-Participation in the "career development" workshop during the Saturday morning session.
CRC Taylor&Francis Publishing Group sponsored student’s prizes for best presentations and posters.
Olli KALLIONIEMI Karolinska Institutet - SE
Alfonso VALENCIA Spanish National Bioinformatics Institute - SP
Gregory BATT Inria - Saclay - Institut Pasteur - FR
Niko BEERENWICKEL ETH - CH
Tom FREEMAN The Roslin Institute - UK
Dominic GRÜN Max Planck Institute - DE
Henning HERMJAKOB EMBL - EBI - UK
Jan KORBEL EMBL - DE
Kathleen MARCHAL Ghent University - BE
Livia PERFETTO EMBL - EBI - UK
Julio SAEZ-RODRIGUEZ EMBL - EBI - UK
Benno SCHWIKOWSKI Institute Pasteur - FR
Vassili SOUMELIS Institut Curie - INSERM - FR
Denis THIEFFRY IBENS - ENS - FR
Jean-Philippe VERT MINES - ParisTech - FR
Thomas WALTER MINES - ParisTech - FR
Lodewyk WESSELS National Cancer Institute - NL
Jana WOLF The Max Delbrück Center - DE
Andrei ZINOVYEV Institut Curie - INSERM - FR
L’objectif du cours est de promouvoir l’intégration d’approches computationnelles dans les laboratoires biologiques et cliniques. Nous avons pour but d’aider les participants à améliorer l’interprétation et l’utilisation d’omics ainsi que les données d’imagerie, qui de nos jours s’accumulent dans n’importe quel laboratoire biologique ou médical.
Atelier de développement de carrière (demi-journée le samedi)
Introduction aux opportunités d’évolution de carrière dans la Bioinformatique et biologie des systèmes du cancer.
Présentation de parcours professionnels (plans de carrières) et assistance aux étudiants par (tables rondes) :
- Experts invités
- Représentants de l’industrie pharmaceutique
- Les éditeurs scientifiques
La sélection des participants se fait sur la base de l’ordre chronologique des inscriptions (« Premier inscrit, premier servi »).
Inscription au cours :
- CV (1 page max)
- Description du sujet scientifique sous la forme d’un abstract (1 page max)
- Lettre de motivation expliquant vos raisons pour assister à ce cours (1 page max)
- Lettre de recommandation de la part de 1-2 personnes.
Les articles scientifiques abordant les sujets principaux du cours seront envoyés aux participants sélectionnés afin qu'ils soient présentés durant le Journal Club.
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Laurence CALZONE Institut Curie – INSERM U900, Paris, France
Tatiana POPOVA Institut Curie – INSERM U830, Paris, France
Andrei ZINOVYEV Institut Curie – INSERM U900, Paris, France
Emmauel BARILLOT Institut Curie - INSERM U900, Paris, France
Gregory BATT Inria - Saclay - Institut Pasteur, Paris, France
Inna KUPERSTEIN Institut Curie - INSERM U900, Paris, France
Vassili SOUMELIS Institut Curie - INSERM U932, Paris, France
Denis THIEFFRY Institut de Biologie de l'École Normale Supérieure, Paris, France
Jean-Philippe VERT Centre of Computational Biology, MINES - ParisTech, Paris, France
Thomas WALTER Centre of Computational Biology, MINES - ParisTech, Paris, France
