2020
28 septembre
02 octobre
visuelCompsysbioV1
Cours 2e & 3e cycle universitaire

Biologie des Systèmes du Cancer

Les promesses de l'Intelligence Artificielle - 3ème edition VIRTUEL

La diversité des tumeurs entre patients mais également entre cellules cancéreuses du même patient rendent l’étude du cancer très complexe. L’idée d’une médecine “personnalisée” ou “de précision” a été suggérée, visant à trouver des régimes de traitement sur mesure pour chaque patient suivant le contexte génétique individuel et le profil moléculaire de la tumeur. Ce défi est réalisable grâce à une caractérisation moléculaire des cancers suffisante, accumulée en utilisant les technologies à haut rendement et des technologies d’imagerie avancée. Cependant, malgré la disponibilité des données de cancer multi-échelles, elles ne sont pas suffisamment exploitées pour nous informer sur les mécanismes dérégulés qui pourraient amener à une meilleure stratification des patients et des traitements spécifiques du cancer.

Registration sur https://meetings.embo.org/event/20-cancer-ai

 

Dû à la situation actuelle de pandémie et les strictes régulations concernant les rencontres présentielles, la formation sera faite INTEGRALEMENT VIRTUEL.

Cours en Anglais
4 ECTS
Date limite d'inscription

Présentation

Objectifs

L’objective de cette formation est de promouvoir une meilleure intégration des approches computationnelles au sein des laboratoires biologiques et des cliniques.

Notre objectif est d’aider les participants à améliorer l’interprétation et l’usage des données multi-échelle qui sont accumulées dans les laboratoires biologiques ou médicaux. Cette année, la formation sera particulièrement ciblée sur les approches d’Intelligence Artificielle (IA) et d’Apprentissage Automatique (AA) pour la recherche contre le cancer. Nous examinerons les méthodes et outils actuels pour l’analyse et l’interprétation des données massives, ainsi que des applications concrètes liées au cancer. En particulier, nous mettront l’accent sur le rôle des méthodes IA/AA pour la compréhension d’hétérogénéité des tumeurs et leurs applications sur le développement de traitements personnalisés.

Nous avons invité des intervenants de différents domaines dans la biologie des systèmes du cancer, spécialement du domaine de l’Intelligence Artificielle (IA) et de l’Apprentissage Automatique (AA) venant des centres de recherche contre le cancer et des cliniques. Ces invités exposeront plusieurs approches pour les données omiques, l’imagerie, l’analyse de données cliniques et leur interprétation, en combinant les réseaux de signalisation avec les données multi-échelles et en leur associant des données cliniques. De plus, les algorithmes de prédiction de sensitivité aux drogues ; l’identification de marqueurs biologiques et de promoteurs du cancer ; les approches de stratification de patients ; les applications de la modélisation mathématique et de l’analyse d’images au cancer orientée sur les approches IA/AA seront présentées.

Registration sur https://meetings.embo.org/event/20-cancer-ai

Dû à la situation actuelle de pandémie et les strictes régulations concernant les rencontres présentielles, la formation sera faite INTEGRALEMENT VIRTUEL.

Discussion et travail pratique

Présentation d'article (participants en thèse de Master)

Présentations de Poster & Flash Talks (participants en Doctorat  & Postdoc)

Travail personnel

Outre la présence aux présentations en lignes, les participants de ce cours devront participer aux évènements en ligne suivants :

-Présentation de leur propre projet scientifique avec une présentation brève et un poster (Pour les doctorants et les post-doctorants).

Les doctorants et post-doctorants présélectionnés devront envoyer:

- Posters taille A0, format PDF.

- Slides au format PDF pour les présentations orales.

-Participation au Journal Club pour présenter et discuter des publications clés du domaine de la biologie des systèmes du cancer. Des articles scientifiques des principaux domaines couverts par la formation seront envoyés aux participants acceptés afin d’être présentés durant le journal club en ligne (pour les étudiants en Master).

Les participants en thèse de Master devront préparer et d’envoyer leurs slides, présentant les articles assignés pendant les sessions en ligne du journal club.

-Participation au workshop de développement de carrière pendant la session en ligne spéciale du jeudi (Tous les participants).

Cette formation sera faite INTEGRALEMENT VIRTUEL.

Information sur les ECTS

La formation validera 4 crédits ECTS pour les étudiants en master et doctorants. La présence à la formation en ligne sera suivie quotidiennement par des formulaires en ligne. Les certificats de formations seront envoyés aux participants après la fin de la formation.

Examen et évaluation

Évaluation des étudiants (par un comité scientifique) :

- Masters 2 : les étudiants seront évalués en fonction de leur présentation au Journal Club + activités générales pendant les discussions scientifiques.

- Doctorants : les étudiants seront évalués en fonction de leur présentation flash + posters + activités générales pendant les discussions scientifiques.

-Il est demandé aux candidats Post-doc de faire une présentation flash et un poster sur leur recherche scientifique. L’abstract le plus significatif sera choisi pour une présentation orale de 15 minutes.

Informations pratiques

Infos pratiques

Ceci est une formation en ligne. L’inscription pour les étudiants et post-doctorants est gratuite. L’inscription est obligatoire pour toutes les catégories de participants.

Suite à l’inscription et en suivant la procédure de selection, les participants recevront l’accès à:

  • Présentations en ligne
  • Vidéos, slides, posters, carnet de formation
  • Tables rondes en ligne
  • Session sur le développement de carrière
  • Présentations du Journal Club
  • Evènements sociaux en ligne

Cliquer ici pour accéder au site d’enregistrement

https://meetings.embo.org/event/20-cancer-ai

Informations pratiques détaillées

Dû à la situation actuelle de pandémie et les strictes régulations concernant les rencontres présentielles, la formation sera faite INTEGRALEMENT VIRTUEL.

Les participants en master présélectionnés recevront des publications clés du domaine. Il leur sera demandé de préparer et d’envoyer leurs slides, et de présenter les articles assignés pendant les sessions en ligne du journal club.

Les sessions en ligne de poster et de présentations brèves par les doctorants et post-doctorants prendront place pendant la formation.

Les doctorants et post-doctorants présélectionnés devront envoyer :

- Posters taille A0, format PDF.

- Slides au format PDF pour les présentations orales.

Registration sur https://meetings.embo.org/event/20-cancer-ai

 

Résultat de sélection
25 août 2020
Il n'y a pas de frais d’inscription pour ce cours
Lieu
TBA
TBA

Effectif maximum

120 personnes

Effectifs

La formation en ligne pourra accueillir jusqu’à 120 étudiants en master, doctorants et post-doctorants.

 

De plus, nous attendons des participants parmi les chercheurs, médecins, et représentants des entreprises pharmaceutiques intéressés à apprendre sur l’impact de la biologie des systèmes sur la recherche contre le cancer et les traitements.

Conditions de selection

Aucune expérience particulière n’est requise en programmation et modélisation, ou connaissances approfondies de la biologie des systèmes. Les présentations seront conçues de manière didactique, proposant aux participants une introduction sur les fondamentaux de la biologie des systèmes et son application dans la recherche sur le cancer.

La sélection des participants se fait sur l’évaluation des candidatures.

Inscription au cours :

- CV (1 page max)

- Description du sujet scientifique sous la forme d’un abstract (1 page max)

- Lettre de motivation expliquant vos raisons pour assister à ce cours (1 page max)

- Lettre de recommandation de la part de 1 personne.

À noter : Si vos référents souhaitent contacter directement le comité scientifique de l’organisation, les lettres peuvent être envoyées directement par courriel à c.sysbiocancer2019 [at] curie.fr () tout en respectant la date limite des applications.

 

Registration sur https://meetings.embo.org/event/20-cancer-ai

Intervenants

Intervenants

Julio SAEZ-RODRIGUEZ Heidelberg University - DE

Lodewyk WESSELS Netherlands Cancer Institute - NL

Susana VINGA  Instituto Superior Técnico - PT

Christina LESLIE SKI - MSKCC - USA

David WEDGE BDI - UK

Andrei ZINOVYEV Institut Curie - FR

Valentina BOEVA ETH - CH Nataliya SOKOLOVSKA UPMC - FR

Thomas‎ WALTER CBIO - MINES - ParisTech - FR

Andrew TESCHENDORFF UCL - UK

Jean-Philippe VERT Google- FR

Olli KALLIONIEMI SciLifeLab - SE

Nasir RAJPOOT University of Warwick - UK

Chloé-Agathe AZENCOTT CBIO - MINES - ParisTech - FR

Florian MARKOWETZ  University of Cambridge - UK

Emma LUNDBERG SciLifeLab - SE

Touati BENOUKRAF MUN - CA

Laura CANTINI IBENS - ENS - FR

Keynote speakers

Nataša PRŽULJ  BSC- ES   Women in Science Lecture

Yves MOREAU KULeuven - BE  

Cette liste d'intervenants n'est pas définitive

Organisateurs

Inna KUPERSTEIN Institut Curie, FR

Emmauel BARILLOT Institut Curie, FR

Yves Moreau, KULeuven, BE

Chloé-Agathe Azencott CBIO - MINES - ParisTech - FR

Denis THIEFFRY IBENS - ENS - FR

Thomas‎ WALTER CBIO - MINES - ParisTech – FR

Comité scientifique

Laurence CALZONE Institut Curie, FR

Tatiana POPOVA Institut Curie, FR

Andrei ZINOVYEV Institut Curie, FR

Soutenu par

Organisation

  • U900 - Cancer et Génome : bioinformatique, biostatistiques et épidémiologie